В настоящее время Космический Центр Кеннеди — это место для запуска кораблей «Спейс Шаттл», повторно использующих комплекс № 39 с инфраструктурой программы «Аполлон». Первым запуском был корабль «Колумбия» 12 апреля 1981 года. Центр — это также место для посадки орбитальных шаттлов — здесь есть посадочная полоса длиной 4,6 км. Тем не менее, первых посадок «Шаттлов», возвращающихся после выполнения своих миссий, в Центре Кеннеди не было до 11 февраля 1984 г., когда «Челленджер» завершил миссию STS-41-B; первым местом посадки до того времени была база ВВС Эдвардс в Калифорнии. К сентябрю 1988 было выполнено 25 полётов с большим промежутком между 28 января 1986 г. и 29 сентября 1988 г. после крушения «Челленджера» (который был первым шаттлом, запущенным с площадки 39B).
В сентября 2004 года часть Космического Центра Кеннеди была повреждена ураганом Фрэнсис. Здание вертикальной сборки потеряло 1000 внешних панелей примерных размеров 1.2 x 3.0 м каждая. Это подвергло опасности элементы здания площадью 3700 м². Разрушения получили участки к югу и к востоку от здания. Крыша была частично сорвана и внутренности были обширно повреждены водой. В дальнейшем повреждения Центра были вызваны ураганом Вильма в октябре 2005 года.
Фотка не моя, но позволяет понять процесс перемещения шаттла на стартовую площадку из центра сборки